直属机构：

学院办公室

团委学生会

专业系（部）：

生物科学系

生物技术系

食品质量与安全系

生物制药系

园艺系

院属部门：

生物实验管理中心

食品质量安全检测中心

甘肃省大樱桃技术创新中心

甘肃省高校农业微生物重点实验室

甘肃省农业固体废弃物资源化利用重点实验室

甘肃省农村绿色发展协调创新中心